伴随着“空间震”这一前所未有的灾害，黄色出现了一些称为“精灵”的神秘少女，黄色对于拥有压倒性力量、被称为灾难的她们，数十年间，人类从未停止对抗她们的步伐。人类通常采取的措施是用武力来歼灭她们，或者是——“与其约会，使其娇羞”！让精灵娇羞，再通过“接吻”即可封印其力量，并转化为自己的力量。拥有这种能力的高中生五河士道，为了人类的和平，也为了拯救精灵们，从而展开了和她们之间的“约会”。士道平时要抑制曾将精灵们卷入斗争的强大灵力，有时为了保护她们也会使用这股力量，通过这样的方式，士道把夜刀神十香等精灵们一次次从危机中解救出来，人类和精灵之间的关系以及处理方法也在悄然改变……同时，也有一些组织使用与士道所在的”拉塔托斯克“不同的手段，与精灵们对峙。短暂的平静即将被打破，士道等人的战争（约会）又要开始了——